18 августа началась российско-шведская война. Украинское казачество несло серьезные потери в тяжелых сражениях с прекрасно обученными войсками Карла 12. В это время Петр рьяно перестраивает по западной модели армию, управление и общество в целом. От всех своих подданных требует безоговорочного подчинения центральной власти, его чиновники контролировали все аспекты жизни. В таких условиях оказалась в опасности и старинная автономия Гетманщины. Но последней каплей, что переполнила чашу гетманских обид и заставила его искать альтернативу царскому покровительству , стал вопрос защиты от поляков. Когда над Украиной вплотную нависла угроза оккупации войсками С. Лещинского ( польского союзника Карла 12), Мазепа обратился к Петру за помощью, но царь ,ожидавший наступления шведов отказал. Нарушив царское обещание защищать Украину от поляков –Петр тем самым освободил и украинского гетмана от его обязательств.28 октября 1708 г. . когда Карл 12 отклонился от прямого пути на Москву и повернул войско на Украину , Мазепа , прежде всего надеясь сохранить свою страну от опустошения , переходит на сторону шведов. За ним последовали 3 тыс. казаков и многие видные старшины. Следующей весной был подписан акт, закрепляющий условия ,на которых украинцы вступили в союз со шведами. Взамен на военную помощь и провизию Карл обещал защитить Украину и не идти на мир с царем до тех пор, пока Гетманщина полностью не освободиться от власти Москвы.

Карательная экспедиция князя Меньшикова на Украину унесла жизни 6 тыс. жителей Бутурлина, и 11 ноября 1708 г старшина избрала гетманом И.Скоропадского. После полтавской битвы (28 июня 1709 г) война была выиграна Петром 1. Россия начала превращаться в великую европейскую державу, относительно украинцев, битва положила конец их попыткам порвать с Россией. Отныне полное поглощение Гетманщины Россией становилось лишь делом времени.

Мазепа и Карл ХІІ, спасшись от преследований, нашли свое прибежище на молдавской земле. Здесь близ г. Бендеры 21 сентября 1709 г. умер 70-летний Мазепа. Ушедшие с Мазепой 50 представителей старшины, 500 казаков из Гетманщины и 3 тыс. запорожцев – стали первой украинской политической эмиграцией. В 1710 г. они избрали гетмана в изгнании - П. Орлика., который составил проект Бендеровской конституции. Мечтал освободить Украину, но его планам не суждено было сбыться.