Эти меры сократили социальную базу повстанцев. В июне 1863 г. руководство восстанием вновь перешло в «красным». В подполье К. Калиновским создано правительство «Литовско-белорусский червоный жонд», но восстание шло на убыль. Вооруженная борьба в Беларуси прекратилась осенью 1863 г., а летом 1864 г. была ликвидирована последняя революционная организация в Повогрудке, К. Калиновский арестован и 22 марта 1864 г. повешен в Вильно. Участники восстания подверглись репрессиям. В Беларуси и Литве 128 повстанцев были казнены, 800 сосланы на каторгу, около 12,5 тысяч человек сосланы. Восстание содействовало пробуждению национального самосознания белорусского народа.